香菇、木耳、平菇等为主的农作物秸杆栽培的食用菌，其经济效益主要取决菌筒制备过程中污染率的高低，常见的污染霉菌有青霉、木霉、链孢霉、黄曲霉和黑曲霉，其中以青霉和木霉危害最重。浸染培养料与菌丝争夺营养、分泌毒素，影响菌丝生长发育，因此，要提高食用菌成品产量，在菌筒培料过程中应采取以下10项技术措施：
1．选用新鲜栽培料。各类食用菌栽培配方众多，原料复杂，大多农作物副产品均可利用。但必须保证新鲜、无霉变，受潮陈旧原料易冷酸霉变，霉菌丛生，不仅消耗了养分，而且不利于食用菌苗丝生长。
2．栽培料预处理。各类材料混配后，其质地坚硬，颗粒粗细不同。为防治菌筒薄膜填料后不被刺破，微小孔眼构成污染通道，必须将栽培料过每平方厘米8-9目细筛。同时起到均匀拌料的作用。
3．合理调配含水。根据不同季节调整配方含水量。高温季节，污染率高，除在配方中添加0.1%-0.2%多菌灵药剂防治外，还可适当降低培养料含水量；低温季节可适当增加培养料含水量，可有效地控制杂苗侵染，而不会影响食用菌苗牡正常生长。
4．及时充实装袋。为防止培养料泛酸，拌好料后，集中劳力装袋。尽可能短时间内结束，必须将半筒填充紧实，否则易引起污染。
5．彻底灭菌。灭菌是否彻底是食用菌生产核心；装袋完备后立即上灶灭菌，减少灭菌前自繁微生物量。切不能追求灭菌数量，导致灭菌锅内蒸气回流缓慢。当堆温达100度时需维护12小时以上才能灭菌彻底。进出灶时，针对塑料袋易被刺破的特点，轻拿轻放，搬运的器具要光滑或内衬垫布，以提高成品率。
6．栽培种选择。优质菌种是栽培成功的基础，各类菌种均有不同属性、适宜温度和对环境要求不尽相同，应根据当地的气候条件和栽培季节来选择最适宜品种。待栽种要仔细检查，看菌种瓶盖是否脱落，瓶内培养基表面是否收缩，选择好的菌种置于接种箱内。在无菌操作条件下，弃掉棉塞，扒弃菌种表面老菌丝换上塑料薄膜块封口等栽。
7．接种室消毒。将接种室地面用0.3%高锰酸钾水冲洗后，待接料筒、菌种、接种工具、胶布、酒精棉花置于无菌室内，按10毫升/平方米福尔马林和7克高锰酸、钾进行熏蒸消毒。
8．接种。必须保护接种场所、工具和接种人员的清洁卫生，以防传递污染，接种孔穴内塞满菌种，并高出筒面1.2毫米，贴胶布时，应将菌穴周围散落菌种碎块扫掉，否则造成个别孔穴污染。
9．正确培养。把接种袋置于15-25℃温度下发菌，堆层高度根据培养室温度而定，温度高堆层低，温度低堆层高，菌丝培养期间要经常换气，保证正常温湿度。如果温度达28-35度，空气湿度达90%以上，就会造成木霉、青霉等杂菌生长优势，把好菌种培养关是防止杂菌污染的关键。
10．科学用药。经常检查菌袋。发现霉菌污染要及时在霉菌点处注射1%克霉灵，既可杀死霉菌又不会影响菌丝生长。当感染呈局部片状时，可在污染处注射5%的石灰水，并用手挤压充分接触霉菌污染面，继续培养，效果与正常菌袋相当，污染严重时挖坑深埋。
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