水灾之后竹荪常易发生的病原菌有：黏菌、烟灰菌，害虫：蛞蝓、白蚁、螨类等。防治方法介绍如下，供菇农参考。
    1、黏菌：发生在竹荪畦面裸露土或覆盖的稻草上，初期为黏糊糊，会变形运动，呈乳白色、橙黄色、黄绿色，使菌丝生长受抑或逐渐消亡，严重时不再生长竹荪；竹荪菌蕾受到危害呈水渍状、霉烂。防治措施：加强通风。初期可用多菌灵、70％甲基托布津1000倍、硫酸铜1：500倍、10％漂白粉连续喷洒3-4次。
    2、烟灰菌：常发生在高温高湿环境。初期在竹荪畦面覆土层出现脏白色绒毛状菌丝，很快变成粉红色、黑色，菌落呈深烟灰色，并产生大量的黑色孢子。其主要为害竹荪菌丝，导致菌丝断裂，直至死亡。防治方法：早期出现脏白色绒毛状菌丝时为治疗最佳期，此时可直接在病症处喷洒3％的石碳酸或2％甲醛。当出现黑色孢子时可用2O倍的福尔马林加甲基托布津(70％)可湿性粉剂700倍稀释液喷施。严重时在发病处周围挖断培养料，在患处及周围撒新鲜石灰，用塑料膜将病患处盖住，控制其扩散。
    3、蛞蝓：一种软体动物，俗称“鼻涕虫”，无外壳，身体裸露，主要吞噬竹荪菌球，造成菌球穿孔，并留下一道白色黏液。防治方法：用1：50：50的砷酸钙、麦皮、水置于蛞蝓出没的地方诱杀，或在蛞蝓出没的地方喷洒5％煤酚皂溶液、50％食盐水滴杀。
    4、白蚁：为害竹荪常见的白蚁有家白蚂蚁、黑翅土白蚁、黄翅大白蚁。能蛀食竹荪菌丝，影响竹荪产量。防治方法：追寻蚁巢和主要蚁路，用80％亚砷酸、15％水杨酸、5％氧化铁配成毒剂施入，每巢喷6-15g即可全巢死亡。
    5、螨类：在高温高湿时容易爆发，竹荪菌丝生长阶段以及出菇阶段均有发生，能把菌丝咬断，菌丝萎缩不长，也能咬竹荪菌球，并传播病菌，发生严重时造成绝收。防治方法：用2．5％天王星2000倍液或者其他专用杀螨剂进行喷杀。