一、茶树菇种植中的杂菌预防
种植茶树菇的过程中，对于杂菌侵染，重点不在治疗，而在于预防，并且这种预防要持续整个种植周期所经历的每一个步骤。
1. 菌种和培养料原料的使用
从预防杂菌出发，菌种和培养料原料的使用都不能带有杂菌。对使用的菌种要做好检查和检测，必须杜绝使用带菌菌种。对使用的培养料原料要新鲜，要无腐烂和霉变，降低带菌可能，真正拒杂菌于种植过程之外。
2. 做好培养料灭菌作业，彻底杀灭培养料和菌需物资可能带有的杂菌
培养料灭菌，无论是采用常压灭菌和高压灭菌方法，都要放尽灭菌仓中冷气，要保证灭菌温度和灭菌时长（常压灭菌温度100℃、时长12小时以上，高压灭菌温度121℃、压力0.105Mpa，时长120分钟），常压灭菌还要进行10小时的焖锅处理，真正达到灭菌效果。
3. 严格执行接种操作规程，切实做好接种室和养菌场所及出菇场灭菌
▪茶树菇的接种必须在无菌环境中进行。接种前采用喷洒百菌清等灭菌、药剂紫外线照射，结合必洁仕或菇虫净气雾剂熏蒸的办法，对接种时进行消毒灭菌。接种工具和接种人员着装也同时接受灭菌消毒。
▪接种过程中，管理好人员进出及走动，接种完毕后要避免菌种长时间暴露。
▪接种完毕，菌袋即将进入的养菌（出菇）场所的空间也要提前做好消毒灭菌，可采用硫磺熏蒸方法进行。
4. 做好养菌（出菇）期，场所内外的消毒灭菌
▪茶树菇菌袋进入养菌场所后，要定期对场所内进行定期喷洒灭菌药剂，喷洒药剂位置以空间、墙壁、地面为主，不要直对菌袋喷洒。
▪针对杂菌的无处不在，场所外也应用同样方法进行消毒灭菌，以减少杂菌存在基数。
5. 做好门窗、通风口等与外界相通通道的管理，严防杂菌进入
门窗、通风口等通道要安装防虫网，防止飞虫飞入带进杂菌，通风口应按装过滤装置，防止杂菌进入。同时，门窗、通风口等通道也要定期喷洒灭菌药剂，用以杀灭可能存在的杂菌。
二、遭受侵染的茶树菇菌袋的处理
1. 遭受轻微侵染菌袋的处理
▪对遭受污染轻微的菌袋，密闭移出种植场所后，要在封闭空间进行集中处理。
▪先挖去染菌部分，污染用绿霉净、百菌清或甲醛溶液涂抹挖取患处部分进行杀灭和治疗。菌袋处理完毕后，对污染菌包要集中管理，不能再放回原场所。
▪对挖取的染菌培养料，一样要远离种植场所进行焚烧和深埋。
▪不论是种植场所，还是处理轻微染菌菌包场所，在移出菌包或处理完菌包后，要对场所空间、地面、墙壁进行彻底灭菌处理，喷洒绿霉净、百菌清或其他灭菌药剂。
2. 遭受污染严重的菌袋处理
菌袋受到杂菌污染后，有轻有重，对污染严重的菌袋，要立即用塑料袋或其它不透气的包装物进行包裹，且包裹严密，达到密闭状态。包裹时，动作一定要轻，避免杂菌孢子飞散。包裹合格完毕后，立即移出种植场所，并远离种植场所，对菌包进行深埋或焚烧。
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