在香菇发菌期进行刺孔通气，可增加培养料中氧气含量、排除菌丝生长释放出的废气，加速菌丝生长、缩短菌丝达到生理成熟的时间，正确合理地刺孔通气是秋冬季袋栽香菇优质高产的重要措施之一。

1、缺氧特征：香菇菌丝生长变慢，先端菌丝变细，不够整齐，或有瘤状物产生。表明菌棒内缺氧，必须刺孔通气。

2、刺孔方法：秋季袋式栽培选用的品种多为早、中熟的品种，刺孔以3次为好。

第一次在菌丝圈直径10厘米左右，脱套袋。不套袋的在菌丝圈内侧2厘米的地方刺4～6个孔。第二次在菌丝刚发满全袋后，接种后40～45天，在接种口的另一面进行刺孔，刺孔宜浅，深度1～1.5厘米，每袋刺孔20～30个左右。这次刺孔为小通气，严防孔径太大、刺孔太深、孔数太多，以免导致菌棒在今后培养过程中失水过多，而影响菌棒瘤状物的形成及原基的发生。第三次在脱袋前7～10天，这次刺孔为大通气，刺孔深度要达2厘米，全袋刺孔数为40～60个。

3、注意事项：刺孔的数量和深度主要影响菌棒的增气量、菌棒的含水量及堆温，刺孔的深度及数量要结合菌棒具体实际和环境条件灵活运用。刺孔后，要减少单位面积的堆放量，改“井”字形排放为“△”形排放，以防堆温升高，导致烧菌。