1.菌种生产：传统的三级制种方式是为了适应我国传统的平菇栽培形式，菌种在逐级扩大过程中活力也在衰退，但为了减少生产成本还必须这样去做。平菇的工厂化生产要求采用液体菌种生产方式，不但可以减少菌种的转接次数，而且菌种菌龄短、活力强，制种时间也短(可缩短制种时间50~60天)。但对生产人员的专业知识要求较高，在液体菌种生产过程中应该注意的问题包括:一是要注重检验(包括中间检验和成品检验)，液体菌种发酵终点时的生物量应该在25克/100毫升以上(一般要求菌球的体积比在80%以上)，显微镜镜检无杂菌;二是要注意观察，观察菌球大小和菌球的均匀程度，菌液是否澄清等。我国很多菌种厂在使用液体菌种时之所以经常失败，就在于发酵控制技术和检验手段的欠缺，所以发酵过程一定要经过专业培训的人员进行控制，12小时取样1次按上述要求进行检验。若出现菌液逐渐变浑浊颜色逐渐加深，有霉味酒味等异味，说明菌液中有大量杂菌滋生，发酵失败，要放罐重做。2.菌块生产： 要有高压蒸汽锅炉和高压灭菌器，菌块采用方形压块方式,称为菌砖。之所以选择菌砖而不是菌袋，一是因为方形的菌砖更容易实现机械化生产， 在搬运等过程中更容易实现机械化操作;二是因为方形菌砖便于床架栽培。每块菌砖长X宽X高=50厘米X33厘米X25厘米,重约15千克。菌砖装在尺寸合适的塑料薄膜袋内，袋口只进行简单的压封，不系口(以便于灭菌时排气和接种时方便操作)。再装入铁盒中高压灭菌，灭菌后用传送带传送到冷却室冷却，冷却室不设空调系统但有除湿设备，菌砖靠自然冷却，为了减少搬运过程，冷却后的菌砖就在冷却室进行无菌操作接种，接种一人操作。打开口后迅速用液体菌液喷淋料面，喷淋控制开关在操作者脚下。每块菌砖喷180毫升，接种完后用塑料袋封好。
接种后的菌砖，移人培养室培养，温度23℃，空气相对湿度70%，蔽光。一般18天可以长透菌丝，在培养期间菌砖一定要单层摆放，防止菌温升高造成“烧菌”，为了便于机械操作，凿砖放置在一个边长为90厘米的正方形托盘上，每个托盘放4块，这样就可以使用叉车搬运菌砖。
3.出菇管理：菌砖发好菌后，沿铁盒上预留的9个孔打出菇孔，并用剪刀剪去菌袋下部的4个角，然后脱去铁盒，将菌袋移入出菇房出菇。
首先要将温度降低到10℃。光照强度增加到1500勒,同时加强通风管理，待菌砖上开始有大量黄褐色出菇水出现时,就要开袋出菇。将接种点胶带纸撕开。为了促进现菌，每天定时用冷水喷淋菌砖1次，连续5天，每次喷淋1分钟，待出菇点有大量原基出现时，喷淋时从出菇孔中进人的多余水会从菌袋剪去的四个角排出，温度的调节尽量随着外界气温的变化调节室内温度保持在12℃~18℃，这样既可以节约能源消耗，又可使在栽培过程中因为接近外界条件而使得加热或制冷的时间缩短，减少室内湿度损失和减少空调风扇排风直吹菇体和料面的时间，对提高产量有利。
第一潮菇的出菇使菌砖丧失了部分水分,出现了菌料和塑料薄膜的料壁分离现象，这时要停止喷水72小时，让菌丝恢复生长一段时间，这一时间长短主要根据所栽培的品种有关，一般是在15天左右，菌砖料面义会生长出很多小菇蕾，进人第二潮出菇管理，这时将包裹菌砖的塑料膜全部揭去,使菌砖全面出菇。这种出菇方式因为出菇点较多，出菇主要集中在第一、第二潮菇，因此要绝对保证出菇期间空气相对湿度不低于85%，每天定期喷水，定时通风。这种菌砖在出菇时，有两种出菇方式，一种方式是将菌砖单层排列在床架上，菌砖与菌砖之间有30座米的空院，以便出菇时互不能响，还有一种方式，就是利用双孢蘑菇的栽培床架，就是将发好菌的菌砖除膜后直接在双孢普菇的菌床上覆士出菇，覆士材料也是采用双孢蘑菇生产使用的泥炭士。这种方式产量较高，但长出的平菇菌柄较长，菇形不很漂亮，而且基部带有泥士，采收时使用人工较多，每人每天只能采收200千克，其他方式每人每天可采菇400千克(包括装箱、修整)。在实际栽培中还发现，在栽培床边沿邻近松木床架的地方长出的平菇朵型大，菌盖厚，而且非常明显，是否是松木中的某些成分对平菇的生长产生了促进作用，还是因为边际效应的结果，有待于进一步研究证实。
4.出菇房内设施建造：菇房建设要根据出菇时间和地区以及自己的资金状况确定，刚开始进人该行业，为了节省资金，降低风险,以建设半地下菇房最为实用，这种菇房既有利于采光通风，又能很好地保温保湿。
菇房东西走向，在建造菇房时，一般下挖40~50厘米，将挖出的土方堆在墙体的两侧，但不能埋得太高，防止堆土对墙体造成挤压危害。但必须保障东西两面墙体的坚固性，以便于安装空调系统的各种管道及设备。出菇房的屋顶要做成人字脊形的，从起脊部位与下部培养空间分隔开来，以利于保温。出菇房内设有空调出风口，雾化水设施和各种温、湿度探头，还在每排床架的空隙位置设有排风扇，上，下各有一个，排风扇的开启是靠手动控制的，一般很少启用。每个菇房面积125平方(长X宽=19.5米X6.42米),高4米。每个菇房放三排床架，床架分5层，层重0.6米，实际栽培面积247.5平方(长x宽x层数X排数一16.5米X1米x5X3),产量可达60千克/平方 ,每个菇房每个栽培周期产量247.5X60-14850千克，历时56天，平均日产265千克。每年可栽培6个多周期，年产量在90吨左右。如果是覆土栽培产量可更高。
5.采收保藏： 平菇采收一定要及时，菌盖边缘刚刚形成下翻时马上采收，在采收前1~2小时，用0.6%的食盐水喷1遍雾水，目的有两个，一方面是在工厂化栽培过程中，无论是加温还是降温措施，都会造成空气相对湿度的下降从而使菇体丧失大量水分而发脆，影响品质及运输;另一方面,0.6%的食盐水，有利于菇体的保鲜，对菇体上二次菌丝的形成起到抑制作用。对于生产者来说，采收稍晚,虽然可能会因此使得平菇在这段时间内继续生长增加重量，但对于一些已经成熟的菇体来讲，在这段时间会弹射大量孢子和大量散失水分,再加上菇体品质的下降会得不偿失。因此，及时采收也是生产高品质平菇的重要因素。
平菇采收后，如不能及时修整包装，应该先送入冷库降温，边修整包装边保藏，如用纸箱包装，在纸箱上应覆盖一层塑料薄膜以保持水分，一般经过48小时的保藏，重量会损失5%~10%，自己保藏一般不超过72小时，给超市预留24~48小时销售期，时间过长容易造成菇体变色和在菌盖中心生出二次菌丝而严重影响品质。另外，不能在菇体经长时间冷藏后进行菇体修整(一般不应超过8小时)。否则，冷藏后菇体一般会变得很脆，修整时会严重影响外观品质。
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