香菇开放式接种，菌丝在培养阶段并非是把沾染在菌种上的杂菌孢子吃掉，而是通过隐藏在培养基内潜伏下来，注水时，一但条件恶化，杂菌将呈暴发之势，造成菌棒烂棒，给菇农造成不可挽回的损失，分析原因共有如下几点:

1、菌种

看到有的地方用15cm×15cm的袋子做裁培种，菌种打孔，接种，增氧作种，在许多环节做种过程中，其实已经在操作过程中潜藏了很多杂菌孢子，只是由于前期杂菌菌丝量尚小，香菇菌丝暂时处于优势，在培养香菇菌丝阶段杂菌孢子也随着条件适宜逐步荫发成菌丝而成倍增长，潜伏下来。今年有一家香菇生产企业用空调房出菇，第一次正常出菇后，经养菌注水后，第三天大量烂棒，其实就是香菇菌棒在出菇条件不适时潜伏下来的杂菌大量繁殖成暴发之势造成烂棒。

2、灭菌

很多地方为了适应大规模生产，一次灭菌堆垛越来越大，有得一次灭菌达到一万棒，堆大层数高势必造成杀菌效果不一，堆上层由于先达到100℃，灭菌时间长，往往造成营养流失，中间几间由于灭菌时间温度较适宜，下部几层由于堆大压的大紧，有一部分未达到彻底杀菌放果。有的厂子为了达到彻底杀菌效果，只好用延长杀菌时间，这样造成的结果就是上层由于杀菌时候太长营养物质流失严重，高压杀菌锅杀菌时由于温度高，维生素损失严重，蛋白质炖化，如果杀菌时间短，杂菌可能是杀完了，但由于香菇采用木屑生产，若使用新鲜木屑生产则木屑熟化糖化不够，给后期发菌出菇都造成隐患。

3、开放式接种

多数厂家用加大接种量来创造香菇菌丝生产优势，由于开孔多在发满菌后，第一水份损失严重，第二原接种块在出菇时菌丝都会退化老化，老化退化的菌块就会出现杂菌斑，给出菇提供的营养就会减少，菇的产质量就会下降，后期注水冒水也将严重。

接种时为了达到快接量大，只好二三十人多居一室，人多人的新陈代谢就大，接种空间污染就严重，当打孔后接种前由于地球的引力把污染的空气落在接种穴内，以后随着香菇菌丝一起长，当出菇后随着条件不适，比如通风不良，湿度增大，温度增高，就会造成大量烂棒。