第一种，木霉。危害香菇的木霉主要是绿色木霉，多孢木霉（白色木霉），哈济木霉和长枝木霉（袋栽香菇常发生绿色木霉）。绿色木霉靠分解纤维素为生，也寄生于香菇菌丝体上，适于在15~30℃和偏酸性环境中生长。木霉常常生长在菌棒上的菌落，初期为白色斑块，后来产生绿色孢子，菌落中央是深绿色，向外逐渐变浅，边缘为白色。这是袋栽香菇最常见的、危害很大的杂菌。如果病害发生在袋内培养基上，可用70%~75%酒精，以注射针注入污染处。如果在脱袋后，病害发生在菌棒上，可在污染处喷pH8~10石灰水，喷洒范围要大于污染范围。如果发生了严重污染，可喷0.1%多菌灵溶液进行杀菌。

第二种，链孢霉（脉孢霉）。常见的有粗糙脉孢和间型脉孢霉。一般在接种后2~3天即可发生，当25~30℃时，其孢子经6小时就可萌发，2天后就可长满栽培袋的接种口周围。其菌丝生长很快，传播力极强，但菌丝生长疏松，呈桔黄色或水红色。这是菌棒和菌块栽培过程中常见的杂菌之一，一旦发生，会造成毁灭性的损失。类似链孢霉的还有交链孢霉，菌落为黑色或灰黑色，繁殖很快，可抑制香菇菌丝生长。想要防治这种病害，那么粮食类的培养料必须要防止受潮，不可存放在接种室、培养室附近。在配制培养料时，加1：1000倍多菌灵拌料也可以防治。如果病害已经发生，那么可以用纸或塑料包好，集中烧毁，并对菇房全面消毒。

第三种，青霉。主要有圆孤青霉、绳状青霉和产紫青霉。青霉常发生在香菇的培养料上，影响其菌丝生长和子实体形成。它的菌丝前期多为白色，后期转变成青绿色、蓝色、灰绿色等，孢子是青色的。其生长最适温度是20~25℃。只要加强通风，减少喷水，降低空气湿度，就可以减轻其危害。局部发生这种病害，可喷5%石灰水，当培养料湿度大时撒石灰粉也能防治。

第四种，曲霉。它是危害香菇的常见杂菌，曲霉有些营养菌丝可分化成分生孢子柄，其顶端膨大成球状，成堆时表现出各种颜色。黑曲霉呈黑色，黄曲霉呈黄至黄绿色，棒曲霉呈蓝绿色，烟曲霉呈灰绿色，杂色曲霉呈淡绿、淡红或淡黄色，亮白曲霉呈乳白色。其生长的适宜温度为25℃以上，多发生在发菌阶段的培养料上或脱袋的菌棒表面。感染曲霉后，香菇菌丝很快萎缩，发生刺鼻的臭气，以致菌丝死亡。我们可以通过暂停喷水，加强通风，降低湿度和温度，喷洒500倍液的托布津或多菌灵溶液等方法，对这种病害进行防治。

第五种，毛霉菌和根霉菌。毛霉和根霉的形态及生理特性基本相似，两者常混杂生长。毛霉菌丝浅灰色，无假根和匍匐菌丝，可直接从菌丝体长出孢子囊梗；根霉菌丝灰白色，在培养料上产生弧形的匍匐菌丝，基部有假根，与假根相对向上丛生出孢子囊梗，一般不分枝，顶端形成黑色球形的孢子囊。毛霉和根霉生长的最适温度为25~30℃，空气相对湿度是90%~100%。当空气湿度大，培养料含水量过高，通风不良时，发病较重。两者生长速度都比香菇菌丝快得多，从而在料面形成一个覆盖层，抑制了香菇菌丝的生长。香菇接种时，可以把用种量加大至10%~15%，形成香菇菌丝的生长优势，从而抑制毛霉和根霉的生长。

第六种，细菌和酵母菌。这类杂菌经常出现在营养丰富的斜面培养基上，其菌落繁殖快，出现早，常在接种后24小时出现，在斜面上呈粘稠状。菌落具有各种色泽，可使培养基变色、发酸、变臭。酵母菌繁殖很快，菌落乳白色，可寄生在香菇的子实体上。

防治这类杂菌的主要措施是：试管中培养基灭菌时，用牛皮纸包扎棉塞，以防潮湿；灭菌后慢慢地冷却，防止试管内产生冷凝水，或等其中冷凝水干后再使用；在香菇菌种分离时，种菇表面不应有水；接种器应经过火焰消毒；制作培养基时，每1000毫升中加2片四环素；培养基应偏酸，因为细菌喜微碱性。