感染症状：菌丝退化，生长不良，逐渐腐烂，子实体感染后引起畸形菇发生。

 　　防治方法：在感染处注射１：５００苯来特５０％可湿性粉剂，并用代森锌粉剂５００倍水溶液喷洒菇场，防止扩大传染。

　　二、细菌性病害

　　①褐腐病：病原菌为荧光假单孢杆菌，在香菇的组织细胞间隙中繁殖，使受害子实体停止生长，菌盖、菌柄和菌褶变褐色，最后腐烂发臭。

　　防治方法：搞好菇场及工具的消毒，及早清除病变的菇体。然后用链霉素１：５０倍喷洒菌袋，杀灭蕴藏在菌袋中的病菌，防止第二茬复发。

　　②细菌斑点病：又称褐斑病，病原菌为托兰氏假单孢杆菌，菌落形状大小各异，一般呈灰色。当病菌侵染子实体时，会使菇体畸形、腐烂，菇盖产生褐色斑点，纵向凹陷形成凹斑。若培养基受到浸染，基料会发黏变臭。

　　防治方法：将侵染子实体立即摘除，并喷施１：６００倍次氯酸钙溶液(漂白粉)进行消毒。

　　三、真菌性病害

　　①绿霉菌：是香菇生产中危害最大的竞争性杂菌。初期菌丝为白斑，逐渐生成浅绿色，菌落中央为深绿，边缘呈白色，后期变为深绿色，严重时可使菌袋全部变成墨绿色。

　　防治方法：用２％甲醛和石碳酸混合液或用克霉灵、除霉剂注射受害部位；亦可用“厌氧发菌”法防治绿霉：将感染严重的菌袋单层平放，上覆盖潮细土３～５厘米，待香菇菌丝布满菌袋后取出，此期间须遮阴，常检查，防高温；也可利用温差进行控制，根据香菇菌丝和绿霉菌丝所需温度不同，把感染后的菌袋处理后运出培养室，置于２０℃以下阴凉通风的环境中，可抑制绿霉的扩散，香菇菌丝亦能正常生长。

　　②脉孢霉：又称链孢霉、红色面包霉。在无性阶段初为白色粉粒菌落，后呈粉红色，主要靠分生孢子传播，是高温季节７－８月发生的重要杂菌，来势猛，蔓延快，危害大。该菌一旦发生，菌种、栽培袋将成批报废。

　　防治方法：脉孢菌喜高温潮湿，所以首先避免高温湿环境。在培养料中加入占干料重量０．２％的２５％多菌灵或０．１％的７５％甲基托布津，可抑制培养料中残存的或发菌期侵入的病原分生孢子；菌袋发菌初期受害，应用５００倍甲醛稀释液或用煤柴油滴在未完全形成的病原菌落上；发菌后期受害，可将菌袋埋入３０～４０厘米透气性差的土中，经１０～２０天缺氧处理后可有效减轻病害，菌袋仍可出菇。

　　③毛霉：又称黑霉、长毛霉。菌丝无色透明，菌落初为白色，菌丝长势极快，每日可长３厘米左右，后期呈灰色或黑色。通过降温、通风、防潮防治。

　　④青霉：菌丝前期多为白色，与香菇菌丝很难区分，后期转为绿色、兰色、灰色、肝色，在２０℃～２５℃酸性环境中生长迅速，与香菇菌丝争夺养分，破坏菌丝生长，影响子实体形成。

　　防治方法：加强通风降温，保持清洁，定期消毒。局部发生可用防霉１号、２号消毒液注射菌落，亦可用甲醛注射，进行封闭。

　　⑤曲霉：初期为白色，后期为黑、棕、红等颜色，菌丝粗短。香菇菌丝受感染后，很快萎缩并发出一股刺鼻的臭气，致使香菇菌丝死亡。

　　防治方法：加强通风控制喷水，降低温度和湿度。严重时可用１：５００倍托布津或防霉１号、２号消毒液处理病处。