食用菌是十分适合于工厂化生产的一类农作物，工厂化栽培是最具现代农业特征的产业化生产方式。食用菌工厂化生产采用工业化的技术手段，在环境可控的设施条件下，采取高效率的机械化、自动化作业，实现规模化、集约化、标准化、周年化生产。
国际上最早实现工厂化周年生产的是双孢蘑菇，已有60年的发展历史。1947年，荷兰在控制温度、湿度和通风的 条件下进行工厂化生产，由此开辟了草腐菌工业化生产的先河。而后美国、德国意大利等国相继实现了双孢蘑菇的机械化和工厂化生产。近年来，东欧的波兰等国也 在迅猛发展。日本在20世纪50年代开始，创立了金针菇等木腐菌瓶栽和袋栽的工厂化周年生产模式。20世纪80年代韩国和我国台湾地区也相继引进日本生产 模式，并根据自身条件加以改进，生产规模不断扩大，栽培技术日臻成熟。
我国内地的食用菌工厂化生产走过了一条曲折的道路。自上世纪80年代开始，从美国、意大利等国家先后引进了9条 大型的双孢蘑菇工业化生产线，但是由于技术、市场和管理等问题，除了山东九发能够成功运作外，其余都被迫停产，工厂化生产一度处于低潮。然而自上世纪九十 年代以来，随着经济的发展和市场条件的成熟，国内再次掀起了以金针菇、杏鲍菇、真姬菇等木腐菌食用菌工厂化生产投资热潮。除了台湾、日本一些独资、合资企 业陆续在大陆投资建厂外，国内工商企业也陆续投资开发食用菌工厂化生产；如上海浦东天厨菇业有限公司、丰科生物技术有限公司、北京天吉龙食用菌公司等，以 及省内的龙泉双益菇业有限公司和武义海兴菇业有限公司等，在学习借鉴国外成功经验的基础上，采用引进设备和自创技术相结合的方式，先后获得了成功。此外， 各地小型半工厂化或设施加强型的规模化生产模式更是不断涌现，我国的食用菌工厂化生产正在迎来一个新的发展高潮。
随着经济的发展和市场周年消费需求的不断增强，工厂化生产是食用菌产业发展的必然趋势。 
1　当前国内外实现工厂化生产的主要菇种及模式
当前国内外实现工厂化生产的食用菌主要有双孢蘑菇、金针菇、真姬菇、杏鲍菇、白灵菇、草菇等，其中工厂化生产历史最长、工艺技术最成熟的是双孢蘑菇，其次是金针菇、真姬菇。