臭氧以其特有的气味而得名，它是一种气体强氧化剂，具有杀菌力强，不产生任何残留污染，可直接对食用菌物料，接菌工具，接菌，菌房培养，大棚催芽使用的优点。作为一种广谱高效杀菌剂，其杀菌速度较氯快300-600倍，可以快速杀灭各种细菌繁殖体和芽孢，病毒和真菌，如；寄生性真菌病害：有褐腐病、褐斑病、软腐病、褶霉病、枯萎病、浅红酵母病等。竞争性真菌病害：毛霉，根霉，曲霉，青霉，链孢霉，绿霉。特别是对黑木耳栽培菌制菌期危害最为严重的“红色脉孢霉（Neurosporspp）”杀菌效果极佳。在传统杀菌药物中如；甲醛 又名福尔马林，高锰酸钾 俗名灰锰氧，酒精 化学名称乙醇，多菌灵 又称棉萎灵，气雾消毒盒 商品为灰色粉剂，新洁尔灭 阳离子型表面活性杀菌剂，升汞 重金属盐型杀菌剂，碘福 广谱性杀菌剂，百菌清 有机氯保护性广谱杀菌剂，硫磺 保护性杀菌剂和杀螨剂。杀菌不彻底有死角，药物残留大可造成二次污染，对人有伤害，多年用的菌房内各种细菌形成了对药物的抗性不易杀死。随着人们对化学消毒剂在制菌中对生产人员造成的伤害和化学消毒剂残留造成黑木耳污染的重视。臭氧将成为食用菌行业的新兴消毒剂得到迅速的推广和使用。

尽管在我国的药品生产GMP验证中早已推荐了臭氧灭菌方法，但臭氧在食用菌生产和黑木耳深加工的应用中是在近两年才得到一个蓬发展的机会。使用成功的主要有以下几个方面；
一，食用菌培养室与制菌工具的消毒灭菌
在食用菌厂，臭氧气体用于食用菌培养室，接菌室食用菌培养室，接菌室与制菌工具与制菌工具消毒是非常方便，有效的传统的消毒方法是用甲醛，硫磺等化学试剂熏蒸，众所周知，甲醛，硫磺熏蒸的弊病较多，国外近期研究证明，在控制空气微生物方面，臭氧是甲醛和其它化学熏剂的替代物。通过化学雾化，紫外线与臭氧作消毒剂的对照试验，结论是臭氧既有效又无残留，臭氧“大大抑制” 食用菌培养室，接菌室与制菌工具中各种细菌群体的生长。
其方法是；（1）将臭氧发生器直接放在食用菌培养室，接菌室入门口上方或放在离地面2m-2.5m的地方加以固定，对洁净区进行消毒灭菌（2）大的食用菌厂可以将臭氧发生器放在食用菌培养室，接菌室的外面，通过管道将臭氧打入各输入口中，然后被送入各洁净区，或采用台式自带风机臭氧发生器，多点设计将臭氧散布在洁净区内，统称为外置式臭氧发生器，外置式臭氧发生器安装检修方便。（3）采用臭氧发生器连接导气管和曝气系统，在食用菌培养室，接菌室，黑木耳深加工厂顶部布设曝气管网，将臭氧送入洁净区。特别是在食用菌生产前把各菌房用臭氧提前杀菌消毒。几种方法消毒效果都是一样的。从使用臭氧进行灭菌的食用菌厂的检测报告可看到，菌检全部合格，完全替代了令人头痛的甲醛，硫磺熏蒸大消毒同时，能耗减少，人身健康，取得了满意效果。
现在市场上臭氧产品五花八门，质量不一，主要是有家用小型，食品厂型，没有专用于食用菌木耳和蘑菇的专用臭氧设备。公司专门为此设计的HY-017系列产品，能迅速将臭氧传送到空间的各个地方，电脑定时控制，无死角，可达到百级洁净度。
二，空间的消毒灭菌
（1） 食用菌培养室，接菌室，操作室，工作室，催芽棚，木耳，蘑菇、香菇、平菇载培大棚，黑木耳，蘑菇深加工车间包装车间。利用臭氧消毒杀菌效果极佳。同时可去除各类杂菌和异味污染，保证商检出口质量。按照卫生部消毒技术规范要求，对空间消毒的臭氧浓度是10ppm,即20mg/m3浓度的臭氧，作用40min,对自然菌杀灭率达到98%以上。一般（0.5—1.0×10-6臭氧即可达到90%以上的空气杀菌率。在150m3的培养室内，臭氧消毒2h（臭氧浓度4×10-6=左右=0.000004）前后对照数据；
空气中细菌总数（个/m3）         消毒前/消毒后
食用菌培养室                     1325 / 00
接    菌  室                     1208 / 00
催 芽 大 棚                      2360 /26
深加工包装间                     1587 / 00 
车间灭菌臭氧消毒机厂家根据空间大小，摆放菌代多少设定消毒时间，消毒结束便自动关机，使用方便。按房间空间体积的大小选型使用。只要满足臭氧浓度的要求，必需是食用菌专用的高纯臭氧发生器。就可以达到消毒杀菌目的，其它类型无效。
（2）物体的表面消毒灭菌在食用菌生产过程中，常常要对原材料，工具器材，包装物，生产场所等进行体表面消毒。特别是要对调好的培养基在臭氧消毒下进行多次翻动摊开消毒。在高压灭菌时效果更好，高压灭菌后的菌代口极易感染杂菌这时做表面杀菌非常重要。传统的方法是用紫外线消毒，但消毒不彻底，存在消毒死角，衰减快，对于特定环境中的某些细菌无法杀死等种种弊端。按照卫生部消毒技术规范要求，用臭氧气体对物体表面上污染的微生物的杀灭，一般要求30ppm,即60mg/m3，相对湿度≥70%，作用60min-120min可达到消毒效果。
接菌消毒在准备接菌前开启臭氧机50min，回复30min接菌人员进入接菌室把臭氧机调至低浓度0.1-0.2PPm可进行在无菌下接菌。但事实上，洁净区消毒不仅是对空气的消毒，实际上还包括了对物体表面的消毒所以，高纯度臭氧发生器食用菌专用（其它臭氧机达不到）设计时的浓度一般大于10PPm。菌代刚上架消毒在2h，以后每天40min,就可以保证一天内洁净区内的浮游菌和沉降菌达到SSOP的要求。为黑色木耳，绿色品质，科学消毒。