植物保护学院是学校一所办学历史较为悠久的学院。1930年在原河南大学农学院创建植物病虫害学科，1941年开设植物病虫害专业，1950年建立植物病虫害系，1952全国高校院系调整植物病虫害系被合并到华中农学院。1959年学校恢复植物保护专业，1960年成立植物保护系。1961年植物保护系与农学系合并，1964年恢复植物保护系，1969年再次并入农学系，1975年恢复植物保护系。1994年在植物保护系基础上组建生物工程学院，2001年学校院系调整，撤销生物工程学院，分别成立植物保护学院和生物技术与食品科学学院。在近90年的办学历史中，先后有涂治、陈振铎、王鸣歧、何均、袁嗣令、陈兆骝、贺钟麟、丁文山、杨有乾、王守正、喻璋等老一辈著名植保学家在学院工作，积淀了深厚的学术底蕴，逐步确立了“立足农业，服务河南，面向全国”的办学定位，形成了“自强、力行、求实、创新”的良好院风。
    学院设有植物保护、森林保护、植物检疫、植物科学与技术和制药工程（一本）5个本科专业或方向，其中植物保护专业是河南省建设的名牌专业和国家级特色优势专业。2005年植物保护一级学科获得硕士学位一级学科授权学科，2009年成为河南省一级学科重点学科。学院建有河南省“新型农药创制与应用”重点实验室、河南省“农业有害生物监测预警与防控”重点学科开放实验室、农业部农药登记药效试验单位等省部级科研平台，农业有害生物综合治理研究中心、化学生态研究所、菌物研究所、农药研究所等校级和院级科研平台。学院现有作物安全生产学科博士授权点、农业昆虫与害虫防治学、植物病理学、农药学和作物安全生产4个硕士学位授权点，其中农业昆虫与害虫防治学科和植物病理学科设有省特聘教授岗和校特聘教授岗位。目前在校本科生1100多人，博士和硕士研究生100多人。
    学院现有植物病理系、昆虫系、农药系、植检系和植科系5个系和1个中心实验室，现有教职工58人，双聘院士4人。其中，专任教师41人。在教师中，省、校级特聘教授4人，教授9人，副教授22人，省管专家2人，河南省青年科技优秀专家2人，河南省跨世纪学术技术带头人2人，河南省优秀教师2人，具有博士学位教师30人，具有博士学位教师占73.2%，有15人在国家级、省级学会担任理事、常务理事、副理事长和理事长等学术职务。先后聘任了中国科学院院士谢联辉教授、澳大利亚工程院院士唐文华教授、中国工程院院士吴孔明研究员、中国工程院院士陈剑平研究员等一批国内外知名学者作为兼职教授。
    学院教学工作成效显著。长期以来，植物保护学院形成了良好的教风和学风，教师教学水平和学生培养质量在全校名列前茅。《农业植物病理学》2003年被评为学校第一门省级精品课程，《园林植物昆虫学》被评为国家级双语教学精品课程，《普通昆虫学》、《园林植物病害防治》、《农业昆虫学》、《普通植物病理学》等课程先后被评为省级精品课程、校级精品课程和优秀课程。多名教师被评为河南省优秀教师和河南农业大学教学名师，学院教师主持的教研项目多次获得国家和省级教学成果奖励。学院教师主编了《农业植物病理学实验实习指导》、《烟草昆虫学》、《烟草病理学》和《植保专业外语》等多部国家级统编教材和农林规划教材。学院毕业生考研率长期名列全校前列，自2001年植物保护学院成立以来，连续10年考研率达到40%以上，近五年均超过50%，并多次涌现出整个宿舍同学全部考上研究生的先进典型，本科生一次就业率一直保持在95%以上。先后培养出张世军（原河南省政法委书记）、董庆周（原河南农科院院长）、吴孔明（中国工程院院士，国家杰出青年基金获得者）、王道文（国家杰出青年基金获得者）、李大伟（国家杰出青年基金获得者）、唐震（红日国际集团董事长）、朱健（河南臻美置业董事长）等大批优秀毕业生。在恢复高考三十年来2000多名毕业生中，目前已获得高级技术职称、获得博士学位或副县（处）级以上行政职务的毕业生达500多名。
    学院科研工作成就斐然。近年来，先后主持和承担国家自然科学基金项目、863和973项目、国家科技支撑计划、国家转基因重大专项、国家科研平台建设项目、国家公益性行业科技专项、教育部、农业部和河南省重大、重点科研项目100多项，获得国家科技进步二等奖1项，省部级科技进步一等奖2项，二等奖20多项，申报国家发明专利30多项。近年来，先后学院教师在国内外核心期刊发表学术论文500多篇，其中70多篇被SCI收录，主编各类学术著作和图书30多部。近年，发现植物病虫害新种和新纪录30多个，病虫相关新基因20多个。