1987年建校之初，我院成立了化工系和生化工程系，1996年合并为生物与化学工程系，2006年成立生物与化学工程学院。
　　一、教学科研机构、专业设置
　　目前生物与化学工程学院设有生物工程、化学工程与工艺、食品科学与工程和应用化学四个本科专业。生物与化学工程学院现有基础生物与化学实验中心（无机及分析化学实验室、有机化学实验室、物理化学实验室、分析检测实验室、生物化学实验室、微生物学实验室），化学工程技术实验中心(化工原理实验室、化学工程与工艺专业实验室、应用化学专业实验室、化工过程仿真技术实验室），生物与食品工程技术实验中心（生物工程专业实验室、食品科学与工程专业实验室、分离技术实验室）和南阳市工业微生物重点实验室。其中基础生物与化学实验中心于2002年通过了省基础实验室评估验收。另外本院还设有化工工艺、精细化工、发酵工艺、食品工艺和基础五个教研室。
　　二、专业介绍
　　生物工程
　　培养方向：本专业培养掌握化学、工程学和生物技术基本知识，具备工业生物技术产品生产管理、技术开发以及最新生物技术成果应用能力，适应生物技术行业生产和开发需要的高级工程技术人才。学制四年。
　　主要课程：有机化学、生物化学、微生物学、生物工程设备、生物工艺学、抗生素工艺学、生物技术制药等。
　　就业方向：学生毕业后适合在生物制药、生物能源、生物化工、发酵食品企业及相关的技术监督、质量管理等部门从事生物技术产品的生产管理、质量检验和技术开发等方面工作。
　　化学工程与工艺
　　我院与新西兰维多利亚大学洽谈合作办学事宜
　　培养方向：本专业培养掌握化学工程技术和工艺基本知识，具备化工生产管理、质量控制、工艺改进和新产品开发以及最新技术成果应用能力，适应化工行业生产、开发和技术进步需要的高级工程技术人才。学制四年。
　　主要课程：分析化学、有机化学、物理化学、高分子化学与物理、化工原理、化工热力学、化学反应工程、化工设备、化工工艺学等。
　　就业方向：学生毕业后适合在化工、炼油、材料、能源、轻工、医药、环保等行业、部门，从事生产管理、质量控制、工艺改进和新产品开发以及新技术、成果转化及应用等工作。
　　食品科学与工程
　　培养方向：本专业培养掌握食品科学与技术、生物技术基本知识，具备技术管理、产品开发、产品质量控制的高级专门人才。学制四年。
　　主要课程：有机化学、生物化学、分析化学、食品加工保藏原理、发酵技术及应用、食品机械、食品加工概论等。
　　就业方向：学生毕业后适合在酿酒、香精香料等企业，以及科研院所、卫生防疫、食品检验等部门从事技术或管理等方面工作。
　　应用化学
　　培养方向：本专业培养掌握化学、化工基本理论、基础知识，具备精细化工产品生产管理、质量控制、工艺改进和新产品开发以及最新技术成果应用能力，适应精细化工行业生产、开发和技术进步需要的高级工程技术人才。专业方向为精细化工方向。学制四年。
　　主要课程：有机化学、物理化学、高分子化学与物理、化工原理、精细合成单元反应、精化反应工程、化工设备、精细化工概论等。
　　就业方向：学生毕业后适合在精细化工行业中的化妆品、涂料、胶粘剂、医药中间体、电镀与表面修饰、功能新材料、环保等部门，从事生产管理、质量控制、工艺改进和新产品开发以及新技术应用等工作。
　　三、办学成效
　　学院历来重视应用型人才的培养质量，注重对学生创新素质和能力的培养，在全国数学建模大赛、"挑战杯"全国大学生课外学术作品竞赛、全国大学生英语技能大赛等比赛中，均取得了优异的成绩。近几年来，我院培养毕业生1000多名，就业率均达到95%以上，考研录取率均保持在20%左右，先后与河南天冠集团有限公司、张仲景大厨房等企业建立了稳固的就业和实习基地。