一，食用菌培养室与制菌工具的消毒灭菌

在食用菌厂，臭氧气体用于食用菌培养室，接菌室食用菌培养室，接菌室与制菌工具与制菌工具消毒是非常方便，有效的传统的消毒方法是用甲醛，硫磺等化学试剂熏蒸，众所周知，甲醛，硫磺熏蒸的弊病较多，国外近期研究证明，在控制空气微生物方面，臭氧是甲醛和其它化学熏剂的替代物。通过化学雾化，紫外线与臭氧作消毒剂的对照试验，结论是臭氧既有效又无残留，臭氧“大大抑制” 食用菌培养室，接菌室与制菌工具中各种细菌群体的生长。
其方法是；（1）将臭氧发生器直接放在食用菌培养室，接菌室入门口上方或放在离地面2m-2.5m的地方加以固定，对洁净区进行消毒灭菌（2）大的食用菌厂可以将臭氧发生器放在食用菌培养室，接菌室的外面，通过管道将臭氧打入各输入口中，然后被送入各洁净区，或采用台式自带风机臭氧发生器，多点设计将臭氧散布在洁净区内，统称为外置式臭氧发生器，外置式臭氧发生器安装检修方便。（3）采用臭氧发生器连接导气管和曝气系统，在食用菌培养室，接菌室，黑木耳深加工厂顶部布设曝气管网，将臭氧送入洁净区。特别是在食用菌生产前把各菌房用臭氧提前杀菌消毒。几种方法消毒效果都是一样的。从使用臭氧进行灭菌的食用菌厂的检测报告可看到，菌检全部合格，完全替代了令人头痛的甲醛，硫磺熏蒸大消毒同时，能耗减少，人身健康，取得了满意效果。
现在市场上臭氧产品五花八门，质量不一，主要是有家用小型，食品厂型，没有专用于食用菌木耳和蘑菇的专用臭氧设备。公司专门为此设计的YJ-10系列产品，能迅速将臭氧传送到空间的各个地方，电脑定时控制，无死角，可达到百级洁净度。
二，空间的消毒灭菌
（1） 食用菌培养室，接菌室，操作室，工作室，催芽棚，木耳，蘑菇、香菇、平菇载培大棚，黑木耳，蘑菇深加工车间包装车间。利用臭氧消毒杀菌效果极佳。同时可去除各类杂菌和异味污染，保证商检出口质量。按照卫生部消毒技术规范要求，对空间消毒的臭氧浓度是10ppm,即20mg/m3浓度的臭氧，作用40min,对自然菌杀灭率达到98%以上。一般（0.5—1.0×10-6臭氧即可达到90%以上的空气杀菌率。在150m3的培养室内，臭氧消毒2h（臭氧浓度4×10-6=左右=0.000004）前后对照数据；
空气中细菌总数（个/m3）         消毒前/消毒后
食用菌培养室                     1325 / 00
接    菌  室                     1208 / 00
催 芽 大 棚                      2360 /26
深加工包装间                     1587 / 00 
车间灭菌臭氧消毒机厂家根据空间大小，摆放菌代多少设定消毒时间，消毒结束便自动关机，使用方便。按房间空间体积的大小选型使用。只要满足臭氧浓度的要求，必需是食用菌专用的高纯臭氧发生器。就可以达到消毒杀菌目的，其它类型无效。
（2）物体的表面消毒灭菌在食用菌生产过程中，常常要对原材料，工具器材，包装物，生产场所等进行体表面消毒。特别是要对调好的培养基在臭氧消毒下进行多次翻动摊开消毒。在高压灭菌时效果更好，高压灭菌后的菌代口极易感染杂菌这时做表面杀菌非常重要。传统的方法是用紫外线消毒，但消毒不彻底，存在消毒死角，衰减快，对于特定环境中的某些细菌无法杀死等种种弊端。按照卫生部消毒技术规范要求，用臭氧气体对物体表面上污染的微生物的杀灭，一般要求30ppm,即60mg/m3，相对湿度≥70%，作用60min-120min可达到消毒效果。
接菌消毒在准备接菌前开启臭氧机50min，回复30min接菌人员进入接菌室把臭氧机调至低浓度0.1-0.2PPm可进行在无菌下接菌。但事实上，洁净区消毒不仅是对空气的消毒，实际上还包括了对物体表面的消毒所以，高纯度臭氧发生器食用菌专用（其它臭氧机达不到）设计时的浓度一般大于10PPm。菌代刚上架消毒在2h，以后每天40min,就可以保证一天内洁净区内的浮游菌和沉降菌达到SSOP的要求。为黑色木耳，绿色品质，科学消毒。