双孢菇脚根发红，菌盖颜色正常，原因是出菇前喷水过多，培养料偏酸，通风不良等。防治方法：加强通风，避开在高温时喷水，根据空气相对湿度和培养料、菇的干湿情况，尽量掌握在籽实体生长最适宜的范围内，出菇期土层含水量不宜过高。采菇前停止喷水，并适当通风。