随着科技进步和人民生活水平不断提高，工厂化食用菌产业的优势越来越多地得到彰显。据了解，食用菌工厂化生产的单位产出所占土地面积不到传统模式的1%，极大地节约了土地资源；通过工业化、机械化大幅提高劳动生产率，其单位产出所用劳动力仅为传统模式的2%，很好地解决了传统农业生产对劳动力的过度依赖。从产品安全卫生的角度看工厂化生产便于建立无害化食用菌病虫害的防治体系，便于对原辅材料进行检测和选择，便于对生产环境的检测和监控，在产品安全卫生品质方面也具有较大的优势。
    经过近二十年的探索，在总结失败教训和成功经验的基础上，我国食用菌工厂化生产正式起步，2010年末，星河生物携工厂化食用菌第一股概念成功登陆资本市场。相关资料显示，2010年，我国食用菌总产量已超过2020万吨，是全球最大的食用菌生产消费国，占世界年总产量的70%以上，但我国工厂化食用菌产量在总产量中所占比重却不足2%。
    据中国食用菌商务网统计，目前，国内在建和已建的工厂化食用菌企业有450家以上，工厂化生产企业主要集中在上海、广东、北京和河南等地。尽管食用菌工厂不断增加，但事实上优秀的食用菌企业需要三大要素的密集聚集才能实现，即资金密集、技术密集和人才密集。而其中食用菌生产技术本身涉及许多农业科学领域的知识，如微生物学、遗传学、生态学、栽培学、气象学等等，入行门槛不低。
    上海蔬菜食用菌行业协会的数据显示，当前食用菌工厂化生产最大规模的品种有金针菇、杏鲍菇和蟹味菇(含白玉菇)三大品种，金针菇以雪榕生物与星河生物分居第一位和第二位；工厂化蟹味菇和白玉菇以雪榕生物日产20吨和上海丰科生物科技股份有限公司日产15吨为前二位。雪榕生物和丰科都坐落在上海奉贤区，是上海工厂化食用菌的代表企业，上海奉贤区也因此被中国食用菌协会评为前二十位2011年全国食用菌产业化建设示范区。
    上海蔬菜食用菌行业协会相关人士称，目前国内工厂化食用菌产业正处上升阶段，上海有关方面也在加大对工厂化食用菌产业的扶持力度。保守估计，10年之内工厂化食用菌比例可达总产量的30%。从趋势上看，今后一段时间内，我国食用菌工厂生产的发展速度要高于欧美和亚洲其它国家，工厂化生产的配套行业也有可能随之崛起。