中国是世界上最早认识食用菌的国家之一。食用菌也伴随着人类文明的进步经历了悠久岁月。东西方文明古国的早期历史文献中，都记述了关于菌类的栽培。

    我国最早有食药用菌文字记载的是在春秋战国时期。公元前四四世纪，庄子在《逍遥游》中就有“朝菌不知晦朔”之句，其意是这种菌死亡非常之快，早晨是个完好的菌，晚上就衰败了。说明我们的先人当时已开始观察菌类的生长习性了。

    战国初列子在《列子.汤问篇》中也说：“朽壤之上有菌芝者，生于朝，死于晦” 。朽壤是有腐朽烂木的土壤，芝生长于其中。在2000年前的史料中已有记载，《吕氏春秋》载有" 味之美者，越骆之菌”。《史记》中有对获各的记载，称为"千岁松根，食之不死"；东汉王充的《论衡》中就谈到“紫芝”可以像豆类在地里栽培。中国最早药学专著《神农本草经》中记载了灵芝可治神经衰弱、心悸、失眠等症，并根据菌盖色泽 ，评述品质高低。6世纪贾思辨的《齐民要术》"素食篇"中详细介绍了木耳菹的做法。7世纪段成式写的《西阳杂俎》中，有关于竹荪的描述。苏恭等人著的《唐本草注》中记载“煮浆粥安诸木上，以草覆之，即生蕈尔”的原始木耳栽培法。唐代韩鄂编的《四时纂要》中，则比较详细地叙述了用烂构木及树叶埋在畦床上栽培构菌的方法。“种菌篇”还对菌子的种植、管理 、采收、于藏以及菌的有无毒性，能否食用， 作了具体叙述。南宋陈仁玉撰写了第一部《菌谱》，其中对侧耳作过“五台天花，亦甲群汇”的评述。还对浙江东南部十一种食用菌列述了名称，并对它们的风味、生长习性和出菇环境等作了精辟的论述。这一时期中国人民认识和利用食用菌知识进步很大。在西方国家中，希腊有一名医师在公元1世纪提出用木屑在畦床上栽培杨树鳞耳的方法。到16世纪末，意大利的一位名医用这种方法栽培成功，后来大力传播。虽然这些办法比较原始，但它具体记载了中国食用菌科学知识的渊源， 具备了为后来半人工栽培的雏形。这一阶段从技术上考虑，完全是靠食用菌的孢子漫天飞，天然生产，人们只是认识了现象，用一句话概括就是"抱子飞扬，天然生长"。这就是食用菌栽培业的诞生。

    中国食用菌半人工栽培，有规模的生产应始于元代，可以说是商品生产的开始。王桢撰写的《农书》详细记载了香菇伐树砍花的栽培法："取向阴地，择其所 宜木，枫楮栲等树伐倒，用斧碎砍成坎，以土覆压之经年树朽，以蕈砍锉，均布坎内，以蒿叶及土覆之，时用泔浇灌，越数时则以槌击树，谓之惊蕈。雨露之余,天气蒸暖，则蕈生矣……采之讫，遗种在内，来岁仍复发"。至今，中国不少地方沿用其 合理的部分。如选树、砍花、惊蕈等。这一时期的技术也逐渐成熟，如潘之恒于1500年完成的《广菌谱》，记载了鸡菌和其他40多种可食菌的生态和利用价值。李时珍著的《本草纲目》对前人记述的20多种有药用价值菌类的名称考证，对形态、栽培、采集方法和药用功效作了详细论述。始于1000多年前的木耳半人工栽培方法，在林区代木，以粥培菌者今日也常有出现。茯苓作为重要药用真菌，也是1000年前就在松根周围掘取菌块，切块就地下种栽培。800年前在浙江西南部山区由吴三公创始砍花栽培香菇的方法，在龙泉、庆元、 景宁三县山区农民遂以伐木栽培香菇为专业积累了在林内选场、倒树、砍花接菌和击树惊蕈的经验。这一时期从技术上总结可以是 "人工砍花，自然接种"。

    中国近代食用菌生产新产业的形成，始于20世纪30年代，上海引进了双孢蘑菇的纯种堆料栽培技术，在向各地推广栽培中，逐步改进操作技术以适应各地的栽培条件，在引种中评比出优良菌株，并改进制种技术，就地以麦秆、稻草为基料，以猪粪、牛粪代替马粪配料，在室外堆制腐熟，还用土粒代替泥炭为覆土等成功经验，扩大了生产。50年代以来，随着战后经济复兴，食用菌生产广泛推广了纯菌丝体接种，像传统的食用菌香菇、木耳，至今仍打孔接种。这一时期的技术比以前有了很大进步，总结为“人工培养纯菌丝，打孔接种”。

    20世纪70年代， 由于人工培养纯菌丝的兴起，并开始采用木屑、棉籽壳等农副产品下脚料栽培食用菌。代料栽培的探索，广开了利用其他农副产品及工业生产的下脚料如啤酒精、甜菜渣、中药渣、废棉等配料堆料，就地取材，使食用菌生产走出山区，向广大农村和城郊区发展。

    21世纪，日产5-50吨的工厂化企业如雨后春笋，在全国各地迅速发展，从2006年的47家，一直发展到2012年的788家。现在食用菌栽培在向工厂化、集约化、园区化发展，中国的食用菌工厂化企业也将在这个发展过程得到迅速的扩张。