灵芝的生活史从孢子萌发开始，经过单核菌丝至双核菌丝和三级菌丝，继而形成子实体，产生新一代的担子和担孢子。分6个阶段简述如下。
    1、分布在灵芝菌管壁上的担子将成熟担孢子弹射出去。
    2、担孢子萌发产生芽管1至多条，每条芽管内含有多个细胞核；后来产生横隔，每个细胞内只保留一个核，形成初级菌丝。
    3、两条异质的初级菌丝相互配合、完成质配，形成次级菌丝。
    4、次级菌丝在基质内生长，形成菌丝体。
    5、菌丝体出现分化，形成子实体原基，由原基发育成子实体。
    6、子实体的子实层上的担子内完成核配、减数分裂，最后产生四个担孢子，成熟后弹射出去。在灵芝的担子中，初期有两个细胞核，经过核配之后，成为一个受精核。在受精核内的核糖体上，有两对等位基因控制着担孢子的亲和性；Aa控制着锁状联合的形成；Bb控制着核的转移。当受精卵完成减数分裂后所产生的四个担孢子核中只能有Aa、AB、aB、ab四种基因组合的一种。但四种基因型中只有AB与ab两种担孢子萌发后形成的初级菌丝之间能结合成有正常发育能力的次级菌丝。所以，理论上，灵芝所产生的成熟的担孢子中，能具有亲和性的比例只占四分之一，即理论上灵芝孢子的繁殖率不会超过25%。